Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRP68Q9UHB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms