Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO40Q9UH90 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms