Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF20Q9UGU0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms