Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms