Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX1-2Q9UD57 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms