Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX2Q9UBZ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms