Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms