Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAE1Q9UBE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms