Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ORC3Q9UBD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ORC3Q9UBD5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms