Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms