Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
RRBP1Q9P2E9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms