Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRD1Q9P1U0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms