Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMCD1Q9NZU5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms