Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf78Q9NZ63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf78Q9NZ63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms