Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC25Q9NXE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CWC25Q9NXE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms