Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMTM6Q9NX76 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM6Q9NX76 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms