Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOMER3Q9NSC5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER3Q9NSC5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms