Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms