Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms