Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4ENIF1Q9NRA8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4ENIF1Q9NRA8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms