Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM5Q9NQX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM5Q9NQX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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