Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM7Q9NQW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms