Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms