Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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