Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAC1Q9NQ79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms