Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms