Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM60AQ9NP50 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM60AQ9NP50 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms