Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK-5Q9HDB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms