Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRHQ9HD43 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRHQ9HD43 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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