Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA4Q9HCM2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms