Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms