Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms