Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPF2Q9H7B2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPF2Q9H7B2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms