Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms