Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP3Q9H6T3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms