Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf49Q9H6J7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms