Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRABDQ9H4I3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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