Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX25Q9H3E2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms