Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP44Q9H0E7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms