Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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HOXD1Q9GZZ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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