Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM39BQ9GZU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms