Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2J2Q9GZM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms