Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCIN1Q9C0H9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRCIN1Q9C0H9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCIN1Q9C0H9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCIN1Q9C0H9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCIN1Q9C0H9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCIN1Q9C0H9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms