Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRCC1Q9C099 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRCC1Q9C099 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms