Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM5Q9C035 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms