Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF1Q9BZW5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF1Q9BZW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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