Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM3Q9BZL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms