Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCD2Q9BXW9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCD2Q9BXW9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms