Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD1Q9BXT4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD1Q9BXT4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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