Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM2Q9BVW6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms